Innen vitenskapen er modell et mangetydig begrep som nærmest hører hjemme i metodelæren. Som abstrakt, teoretisk-metodologisk begrep brukes ordet om en skjematisering eller en matematisk modell. Slik brukt innebærer en modell alltid en forenkling basert på et utvalg av de viktigste trekk i det den skal utsi noe om. Noen, men ikke alle slike modeller, kan gjennom regneoperasjoner brukes til å simulere og forutsi prosesser i naturen eller samfunnet. Fremtidsstudier benytter ofte disse modellene.
Innen vitenskapsteorien er det vanskelig å avgrense modell-begrepet i forhold til nærliggende begreper som teori og paradigme. I samfunnsvitenskap og humanistiske fag har begrepet en uklar betydning, som nærmer seg analogi-begrepet. Det beholder her noen ganger sin dagligdagse betydning av mønster eller ideal. Bruken av modeller i disse vitenskapene er omstridt.