A casa tem o nome de Glücksburg, no norte da Alemanha. Ela própria é um ramo cadete da Casa de Oldemburgo, que é descendente do conde Cristiano de Oldemburgo, que se tornou rei da Dinamarca em 1448 e rei da Noruega em 1450. Como a casa original de Oldemburgo e a Casa de Eslésvico-Holsácia-Sonderburgo-Augustemburgo foram extintas em 1863 e 1931 respectivamente, a casa de Eslésvico-Holsácia-Sonderburgo-Glücksburgo agora é o ramo mais antigo sobrevivente da casa de Oldemburgo, depois do ramo Holsácia-Gotorp.
A casa desce patrilinearmente dos Duques de Eslésvico-Holsácia-Sonderburgo-Beck. O último deles tornou-se duque de Glucksburgo e mudou seu título para Frederico Guilherme, Duque de Eslésvico-Holsácia-Sonderburgo-Glucksburgo. Ele era casado com a princesa Luísa Carolina de Hesse-Cassel, a neta do rei Frederico V da Dinamarca.
Nem os duques de Beck e os de Glucksburgo eram governantes soberanos; mantiveram suas terras em feudo aos duques soberanos do Eslésvico e Holsácia, ou seja, os reis da Dinamarca e, antes de 1773, os Duques de Holsácia-Gottorp.
Cristiano de Eslésvico-Holsácia-Sonderburgo-Glucksburgo, o quarto filho do duque Frederico Guilherme, foi escolhido pelo rei Frederico VII da Dinamarca, sem filhos, para ser seu herdeiro, por Cristiano ser casado com a prima de Frederico, Luísa de Hesse-Cassel, apesar da lei sálica vigorar na Dinamarca nesta época. Ele se tornou o rei da Dinamarca como Cristiano IX em 15 de novembro de 1863.
Guilherme, o segundo filho do príncipe Cristiano e da princesa Luísa, foi eleito rei dos Helenos em 30 de março de 1863 para suceder o deposto Otão da Grécia e tomou o nome de Jorge I da Grécia.
O príncipe Haakon, o segundo filho de Frederico VIII da Dinamarca, filho mais velho e sucessor de Cristiano IX, tornou-se rei da Noruega em 18 de Novembro de 1905 como Haakon VII da Noruega.
As filhas de Cristiano IX, Alexandra da Dinamarca e Dagmar da Dinamarca, casaram-se com Eduardo VII do Reino Unido e Alexandre III da Rússia respectivamente. Como resultado, em 1914, descendentes do rei Cristiano IX foram mais prevalentes em tronos europeus do que os da rainha Vitória do Reino Unido, dando à Cristiano o apelido de "Sogro da Europa".